Научно-методический отдел осуществляет научно-исследовательскую, методическую и информационную деятельности и взаимодействует с библиотеками вузов города Омска, областным центром — Омской государственной областной научной библиотекой им. А. С. Пушкина и региональным методическим центром — Научной библиотекой Томского государственного университета.

Основные направления в работе отдела:

• оказание методической помощи в организации библиотечной и информационно-библиографической работы отделам библиотеки и библиотекам вузов Омска;
• сбор, обработка и анализ статистических данных, отчетов библиотек вузов Омска;
• проведение библиотековедческих и социологических исследований в целях изучения эффективности библиотечной деятельности и дальнейшего ее развития;
• подготовка материалов и рекомендаций в помощь формированию нормативно-правовой документации библиотеки;
• подготовка материала о научной, методической, образовательной и просветительской деятельности научной библиотеки ОмГУПСа;
• повышение профессионального уровня сотрудников библиотеки;
• участие в организации и проведении областных совещаний, конференций, семинаров и круглых столов.